读音：[ben3 yin1 miao4 jiao4 zhu3]
指久远元初的自受用报身如来，即日莲大圣人。“本果妙教主”的相对词。教主是佛之意。相对于释尊是脱益本果妙之佛，日莲大圣人则是下种益本因妙之佛。日本大石寺第二十六世日宽的有云：“释尊是熟脱之教主，莲祖乃是下种之教主，故名本因妙之教主。应知、三皇五帝是儒教之主，无畏三藏是真言之教主，天台大师是止观之教主，今以本因妙之教主、称我莲祖有何不当”（六卷抄第七○页）。云：“本因妙教主、本门大师、日莲”（第八八九页），又云：“我等内证之寿量品者，脱益寿量文底本因妙之事也。其教主吾也”（第八九七页）。