普贤菩萨之修法，有显密二法。
1.显教：即依‘观普贤菩萨行法经’及‘法华经’所说，以普贤菩萨为本尊，谛观诸法实相中道理，忏悔六根罪障。若成就此三昧，则普贤菩萨乘六牙白象示现而摩其顶。
2.密教：即依‘普贤金刚萨埵念诵仪轨’所说，若身口意三密与佛相应，则现成普贤身，称为普贤三昧。‘诸佛境界摄真实经’上（大正一八·272 A）依普贤三昧体及金刚三昧微妙坚牢和力，出现普贤大菩萨身。又普贤、文殊二大士为双对法门，普贤菩萨主司一切三昧，文殊菩萨主司一切般若，助佛教化，故相对于文殊般若而称普贤三昧。‘华严经探玄记’卷十八［大正三五·441 C］：普贤三昧自在，文殊般若自在!
［法华三昧忏仪、摩诃止观卷二下］